倒置金相顯微鏡相對于正置金相顯微鏡較特殊一些，主要區別在于物鏡位于載物臺下方。主要應用于規格大的、不規則樣品的觀測，也可用于需要尋找特定范圍目標的觀察研究和分析。
倒置金相顯微鏡的操作注意事項：
1、鏡頭清潔：
由于物鏡鏡頭是朝上的，很容易附著灰塵，因此保持鏡頭清潔尤為重要。鏡頭表面必須保持清潔，如果鏡頭表面有灰塵，可使用吸耳球吹除，也可用軟毛刷輕輕的拂掉。
2、機身部件清潔：
用軟布蘸少量中性洗滌劑輕擦機身及鏡頭以外的部件即可；千萬不可用有機溶液清洗劑擦抹部件表面，尤其是對塑料零件，更不能使用有機溶液清洗劑清潔。
3、調焦：
為避免劃傷物鏡，調焦時千萬注意不要使物鏡碰到試樣。
4、亮度調節：
在調整亮度時，切忌忽明忽暗，更不要過亮，有助于保護視力，同時也避免影響燈泡的正常使用壽命。
5、切換：
當載物臺墊片圓孔中心的位置偏離物鏡中心位置時，不要切換物鏡，以免物鏡被劃傷。
功能切換時，動作一定要輕，要切換到位。
6、工作間歇：
儀器工作間歇，為防止灰塵進入鏡筒或透鏡表面，目鏡可留在鏡筒上，并蓋上防塵蓋，或用防塵罩將儀器罩住也可。
7、設備移動：
金相顯微鏡盡可能不要移動。如需移動，應輕拿輕放，避免碰撞。
禁止隨意拆卸儀器，尤其是中間光學系統或重要的機械部件，以避免因不當拆卸而降低儀器的使用性能。
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